學習目標
先備知識
用 R 與 chromatographR
從入門到進階分析層析資料
以 HPLC-DAD/UV 為主，逐步學會資料匯入、前處理、保留時間校正、找峰、峰擬合、peak table 與光譜判讀。每章都連接程式碼、圖表、數字證據與分析決策。
12 個漸進章節入門 → 中階 → 進階
內建資料可重跑Sa、Sa_pr、Sa_warp、pk_tab
分析證據導向不是只調參數，而是學會判讀
R ConsolechromatographR 0.7.5
# 安裝一次，再載入套件
install.packages("chromatographR")
library(chromatographR)
data(Sa)
plot_chroms(Sa, lambdas = 210)
課程地圖
先建立 R 與層析資料的共同語言，再完成完整工作流，最後進入 DAD 光譜、批次分析與品質證據。
入門第 1–4 章
中階第 5–8 章
進階第 9–12 章
從原始訊號到可分析的 peak table
每一步都有不同的輸入、輸出與診斷問題。網站會要求學生說明「為什麼這個結果可信」。
核心函式索引
課程只使用官方文件中可核對的函式與物件。點選函式可直接進入對應章節。
參考資料與方法來源
教學圖表為依據公開方法概念重繪的互動示例，不直接複製論文圖像。
chromatographR 官方網站與 vignette套件安裝、資料與完整 HPLC-DAD 工作流。
chromatographR 0.7.5.9000 Manual函式參數、回傳物件、範例與方法限制。
Wehrens, Bloemberg & Eilers (2015)alsace：前處理、alignment 與 peak table 工作流的重要方法來源。
Clifford & Stone (2012)VPdtw：variable penalty dynamic time warping。
Lan & Jorgenson (2001)exponential–Gaussian hybrid 峰形與擬合。
Bass (2026), chromatographR 0.7.5研究或發表使用套件時，請依官方建議引用。